以下をご確認ください。

・必要なファイルは全て転送されていますか？

・パスは正しく記述されていますか？Ｐｅｒｌであればパスは以下のようになります。
/usr/local/bin/perl

・スクリプトの一行目は以下のように記述してください。
#!/usr/local/bin/perl

・転送モードを正しく設定して転送していますか？
cgiやpｌなどのスクリプトファイルはasciiモード（テキストモード）で転送してください。

・全てのスクリプトファイルの改行コードは統一されていますか？
一部のスクリプトファイルの改行コードが違った場合もエラーの原因となります。

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